知床半島被選為世界自然遺產的關鍵因素是每年冬天漂流而下的流冰孕育了這裡的海洋生態系，而棕熊、貓頭鷹等陸地生物再捕獵海洋生物，進而形成了一個完整的生態圈。因此海洋生態也是知床觀光很重要的一個環節，夏季知床最「定番」的玩法就是走訪知床五湖及搭乘觀光船，日本國內遊客也都會將這兩個項目列為知床旅遊重點。
海洋生態中像是「海中王者」虎鯨在羅臼側的根室海峽就有400頭，而抹香鯨則是有200頭（2019年調查資料），而主要棲息在北海道的天賣島及知床半島的眼鏡海鳩，則是約有200隻棲息於宇登呂側的鄂霍次克海。其他還有丹式鸕鶿、灰背鷗及白腰鼠海豚等也都有機會看到。
除了這些海洋生物之外，更是可以透過搭乘觀光船，以安全的距離一探棕熊最原始的生活樣貌，可能是帶著小熊沿著河岸行走的母熊、努力在陡峭岩石攀爬或是河裡抓魚的成年棕熊。
從宇登呂側出發的觀光船更能從海上欣賞知床半島的斷崖絕壁及大自然的鬼斧神工，像是知床八景中的乙女之淚瀑布（フレペの滝）及神之水溫泉瀑布（カムイワッカ湯の滝) 更是要從海上才能感受其壯闊。
從上述的介紹應該會發現在知床半島可以搭船的地點分為宇登呂及羅臼兩側，兩邊所能看到的風景及乘船目的完全不一樣，乘船碼頭也相距40公里，時常有遊客搞不清楚集合地點，而錯過乘船時間。LANTOKO將這兩側的差異性及船公司資訊整理如下，大家可以根據自己的需求預約，文末另有提供LANTOKO限定的優惠方案。
羅臼
目前也有一本繁體中文的「知床・羅臼海洋生態手冊」，裡面不只詳細介紹了羅臼的海洋生物，從鯨魚、海豚到海鳥之外，就連羅臼的海鮮美食、昆布文化等都有介紹，一本小冊子只要300日圓，就可以完整認識羅臼的海洋魅力，非常值得！在所有賞鯨船公司都可以買得到喔！手冊後面還有一個集章小活動，集滿三個就可以在羅臼觀光案內所兌換紀念品囉。
另外也推薦喜歡虎鯨的朋友，千萬不要錯過羅臼神社限定的虎鯨御守，而在5~8月甚至還有期間限定的虎鯨圖樣御朱印可以收藏喔。（羅臼神社地圖連結）
宇登呂
以欣賞知床半島的大自然景觀及尋找棕熊為主，看到鯨魚及海豚的機率並不大。宇登呂的觀光船行程可以很大略的區分為大型船及小型船。在這邊將大型船與小型船的差異整理成表格，幫助大家了解。
| 大型船 | 小型船 | |
| 與景點的距離 | 較遠（因船隻噸位大） | 較近（會保持安全距離） |
| 是否容易看到棕熊 | 離岸邊距離遠，不易發現，建議使用望遠鏡 | 肉眼可見，若有望遠鏡更佳 |
| 適合搭乘對象 | 可容納人數多，團體旅客或輪椅族等行動不便者 | 想近距離感受大自然的震撼，偏好室外甲板的座位 |
| 是否容易停駛 | 因其船體大較穩定，即使小型船停駛時，也有機會出船 | 可能因風浪大等天候狀況而取消，尤其是春秋時節 |
| 是否容易暈船 | 視當天海上狀況及個人體質而定，可於購票時詢問櫃台 | 視當天海上狀況及個人體質而定，可於購票時詢問櫃台 |
大型船：
知床觀光船極光號Aurora：即是冬天流冰季節在網走的破冰船，夏季時是在知床航行喔！
小型船：
小型船公司們的收費一致、行程路線相同，如果有棕熊出沒，船長也會互相分享情報。會需要考慮的是各家預計出船的行程及航班出發時間是否符合你的旅程計畫。
※小型船公司皆備有免費停車場（除了極光號需收取停車費以外）
三種特色行程任你選
認識完船型的差異後，來選行程囉！各家的行程名字都有點不同，有些甚至只有日文版，是否搞得一頭霧水了（笑）其實葫蘆裡賣的藥都是一樣的啦！全部就只有三種行程路線，只要參考下方的比較表格，就能選出最適合自己的行程囉～
| 行程名稱 | 特色 | 航程 | 季節 | 棕熊機率 | 費用 |
| 硫磺山 /kamuiwakka瀑布/カムイワッカ | 可飽覽知床主要的自然風景 | 小型船：1hr 大型船：1hr30m |
① 4月28日〜5月31日 ②10月1日〜10月20日 |
≒30% | 小型船：4000日圓 大型船：3500日圓 |
| Rusha灣/ルシャ海岸 | 涵蓋硫磺山路線+棕熊的聖地Rusha灣 | 小型船：2hr | 4/28~10/20 | 80%↑ | 小型船：6000日圓 |
| 知床岬/知床世界遺産 | 涵蓋上述路線+抵達知床半島的尖端知床岬 | 小型船：3hr 大型船：3hr45m |
6/1~9/30 | 80%↑ | 小型船：9500日圓 大型船：7800日圓 |
Rusha灣行程是上述行程中最熱門的行程，因此也比較容易客滿，建議提早預約喔！以哥吉拉岩觀光為例，船上雖為自由座，但乘船順序是依照預約順序安排的，越早預約的人越可以提早搭船選位。另外航班時段及預約細節請直接從船公司官網確認喔～～
※補充：行程費用均為大人價位，小學生半價，小學生以下幼兒免費。
棕熊棲息地 - 知床
大家來到知床的目的之一，一定是希望能有機會看到野生棕熊。事實上，在馬路邊或是知床五湖內要看到牠們的機率並不高，也有一定的危險性。因此，非常推薦透過搭乘觀光船來尋找棕熊，小型觀光船公司們在航行時如果發現棕熊，也會利用無線電互相通報，讓不管是搭乘哪一家的乘客都能有很高的機率看到棕熊喔。
推薦閱讀：「北海道旅遊必讀！你一定要了解的棕熊注意事項」
船班常見日文用語
知床半島氣候多變，天氣預報也常失準，航班能否出航會依據所有船公司當日的判斷，最遲會於出航的一小時前決定。如遇天氣驟變，更有可能於乘船前臨時取消，敬請見諒。以下介紹幾個在知床搭船時，會在船公司網頁或是當地飯店張貼的當日航班資訊中看到的日文，只要能看懂這些日文，也能直接確認自己所預約的航班是否能順利出航。
- 通常運航：順利出航。
- 欠航：航班取消。
- 天候調査：仍在觀察海上狀況中，會於出航的一小時前決定。
- 途中折り返し：如船長於航行途中因天候、海象變化而判斷不適合繼續行程，則會提早折返回港口，請下船後回到購票處領取部分退費的費用，費用將依據未航行路段之比例退費，各家船公司將有其退費原則。
乘船前小提醒
服裝
建議穿著具保暖及防風功能的外套。夏天的陸地及海上溫差可達十度以上，如欲在甲板欣賞風景更需多準備。
暈船藥＆望遠鏡
各家業者均有暈船藥販售及望遠鏡租借服務，望遠鏡租借費用及等級依各家有所不同。
選位小秘訣
船隻行進方向的右側！所有船隻都是去程沿途景點介紹，回程從外海航行，遠眺知床連山，運氣好的話，更有機會在回程看到海豚喔！
最低出航人數
各家業者均有訂定最低出航人數，其標準不一，如未達所制定的最低人數，將於前一天或當天上午決定是否取消該航班，也會協助介紹至其他預計出航的船公司。
哥吉拉岩觀光售票處
乘船集合點
LANTOKO限定優惠
凡於「哥吉拉岩觀光」購票時，出示LINE優惠券，即可享有船票500日圓現金折價優惠。
★請參加當日於櫃檯報到付款時出示！如完成付款後才出示，將無法使用折扣。
・使用折價優惠時限「現金」付費，小學生折扣則為半價250日圓。
・宇登呂觀光船的任何航班、羅臼賞鯨船皆適用。
・LANTOKO優惠不可與其他折扣方案併用。
※使用折扣請遵守上述注意事項，並請保持禮貌，勿造成店家困擾。
如何獲得優惠券？
請先加入LANTOKO的Line官方帳號（點我加入，或是搜尋ID:@237rpnez）。從Line對話框輸入「優惠」，即可看到哥吉拉岩官網優惠券。
另外如果是預計宇登呂觀光船及羅臼賞鯨船兩邊都要搭乘的話，推薦選擇哥吉拉岩觀光的超值套票最優惠喔！（超值套票請點我 ）
※使用超值套票即不可使用LANTOKO優惠。
為什麼推薦哥吉拉岩觀光
哥吉拉岩觀光是嚮導LAN原本任職的公司，在職期間致力於促成公司官網、文宣資訊的繁體中文化，希望讓華文圈的遊客能無語言隔閡地參與行程，透過乘船感受知床的大自然魅力。航程中船長會沿途用日文介紹景點，如發現野生動物如棕熊、海鵰等會即時告知之外，另外也有提供中文景點介紹手冊的免費租借，供乘客於船上翻閱，得以更認識知床之美。（請於當日購票時索取手冊）
不管你要搭乘哪家公司，都建議事先預約，才能選到比較好的位置！而小型船公司都會在乘船前一日向所有預約者再次確認預約內容，如乘船日天氣狀況不佳，也會提醒你。建議大家一定要回覆行前確認的訊息，如果要取消，也請務必聯繫喔！因為小型船的可乘船人數並不多，當天no show的預約，除了會讓大家留下外國人愛爽約的印象之外，也會造成其他想搭船的人沒辦法搭乘，請大家一起當個有禮貌的旅人。
常見問題
Q：船內是否可飲食？
可以，大型船上有販賣部，小型船的船上則無，可事先準備。
Q：從知床五湖到乘船處需要多久？
車程約20分鐘。如搭乘巴士，請事先確認巴士時刻表：知床線夏ダイヤ，可在宇登呂溫泉巴士站下車，約步行5~10分鐘即可抵達各觀光船報到處。
Q：什麼時段的班次比較容易看到棕熊呢？
棕熊是野生動物，我們無法掌握牠們的行蹤，因此並沒有特別哪個時段而有較高機率喔！
Q：會建議上午還是下午搭船呢？
可以依據你的行程來決定就可以！上午跟下午的差別，僅在於上午會因為太陽位置而有些許逆光，但現在手機都很厲害，個人覺得差異並不大！